有机垃圾微生物处理设备的处理模式主要包括厌氧处理和好氧处理两种方式。

厌氧处理是指在无氧条件下进行有机垃圾的处理。首先，将有机垃圾投入到密封的处理槽中，然后通过加入厌氧微生物菌种，如厌氧菌和产气菌，来进行分解和发酵。在这个过程中，厌氧菌会将有机垃圾中的有机物质分解为有机酸和气体，如甲烷和二氧化碳。产气菌则会产生大量的气体，增加处理槽内的压力。通过收集和利用产生的甲烷气体，可以用于发电或供热等用途。

好氧处理是指在有氧条件下进行有机垃圾的处理。首先，将有机垃圾投入到通气的处理槽中，然后通过加入好氧微生物菌种，如好氧菌和腐生菌，来进行分解和降解。在这个过程中，好氧菌会利用有机垃圾中的有机物质进行呼吸作用，产生二氧化碳和水。腐生菌则会分解有机垃圾中的纤维素和木质素等难降解物质。通过对处理槽内的氧气、温度和湿度等条件的控制，可以促进好氧微生物的生长和活动，加快有机垃圾的降解速度。

综上所述，有机垃圾微生物处理设备的处理模式主要包括厌氧处理和好氧处理两种方式。这两种处理方式都能有效地将有机垃圾进行分解和降解，减少垃圾的体积和对环境的污染，同时还能产生可再生能源，如甲烷气体。